Бактерия построила ДНК по белку — поток жизни пошёл вспять
Кишечная палочка умеет строить ДНК, используя как шаблон не РНК, а собственный белок — и собирать двойную спираль из двух нитей, созданных независимо. Открытие Колумбийского университета ломает классическую схему «ДНК → РНК → белок» и объясняет, как бактерия жертвует собой, чтобы остановить вирус.
Представьте, что повар испёк торт, а потом по его вкусу и текстуре восстановил рецепт — без единой записи. Примерно такую странность обнаружили биологи из Колумбийского университета: бактерия научилась создавать ДНК, используя как шаблон не другую ДНК и даже не РНК, а белок. Привычная цепочка «ДНК → РНК → белок» вдруг развернулась в обратную сторону, и это, пожалуй, один из самых неожиданных поворотов в молекулярной биологии за последние годы.
Открытие описано в журнале Cell в августе 2026 года. Группа под руководством биохимика Сэмюэла Стернберга изучала бактерию Escherichia coli — ту самую кишечную палочку, которая служит излюбленным объектом генетиков. Учёных интересовала её защитная система DRT3, часть иммунного ответа против вирусов. Оказалось, что в этой системе два фермента обратной транскриптазы работают совершенно по-разному, и один из них делает нечто, что раньше считалось невозможным.
Классическая схема дала сбой
Обычно всё устроено просто и предсказуемо. ДНК — это двойная спираль из четырёх химических «букв»: аденина (A), цитозина (C), гуанина (G) и тимина (T). Эти основания соединяются по строгим правилам: A всегда в паре с T, C — с G. Благодаря этому одна цепь ДНК служит шаблоном для построения второй. Когда клетка копирует свою ДНК, она расстёгивает спираль, как молнию, и каждая одиночная нить диктует последовательность новой. Если на одной стороне написано A-G-C-T, на другой обязательно будет T-C-G-A.
Иногда в игру вступают обратные транскриптазы — ферменты, способные строить ДНК по РНК-шаблону. Этот трюк используют, например, ретровирусы. Но в любом случае в процессе задействована нуклеиновая кислота: либо ДНК, либо РНК. Белок никогда не выступал в роли чертежа для ДНК. До сих пор.
Белок как чертёж для ДНК
В системе DRT3 работают два фермента: DRT3a и DRT3b. Первый ведёт себя привычно — синтезирует цепь ДНК, копируя последовательность РНК. А вот второй поставил исследователей в тупик. DRT3b создавал очень специфичную повторяющуюся последовательность ДНК без всякой РНК. Как именно — было загадкой.
Ответ пришёл из криоэлектронной микроскопии. Команда Хироси Нисимасу смогла буквально увидеть продукт ДНК, сидящий внутри фермента. Структура показала: две аминокислоты белка расположены ровно так, чтобы объяснить чередующуюся последовательность. Одна аминокислота способствует включению аденина, другая — цитозина. В результате получается простая нить ДНК с повторяющимся мотивом C-A-C-A-C-A.
«В самом буквальном смысле информация из аминокислотной последовательности белка переводится в последовательность ДНК, — пояснил Стернберг. — Это совершенно иной поток биологической информации, чем тот, о котором мы обычно думаем».
Чтобы убедиться, что дело именно в этих двух аминокислотах, учёные изменили их. Синтез ДНК тут же сломался, а вместе с ним и противовирусная защита бактерии. Значит, белок действительно сам задавал последовательность — без участия нуклеиновой кислоты.
Две нити, собранные порознь
Но самое удивительное — как DRT3 собирает двойную спираль. Обычно две нити ДНК не создаются независимо: существующая цепь служит матрицей для новой. Здесь же каждая нить строится отдельно. DRT3a делает свою копию по РНК, DRT3b — по белку. Затем две готовые нити находят друг друга и соединяются, образуя знакомую двойную спираль.
«Это бросает вызов привычной картине того, как получается двухцепочечная ДНК, — отметил Стернберг. — Обычно мы думаем, что одна нить несёт информацию, необходимую для построения другой. Здесь же обе нити синтезируются независимо, с использованием двух совершенно разных типов шаблонов — РНК для одной и белка для другой — и только потом объединяются в двойную спираль».
По его словам, это замечательный пример того, насколько изобретательной может быть эволюция, работая с хорошо знакомыми молекулярными кирпичиками.
Ловушка для вирусов
DRT3 не просто демонстрирует молекулярные фокусы. Это защитная система, и странная ДНК, судя по всему, работает как ловушка для вторгающихся вирусов.
В нормальных условиях фермент RecBCD постоянно уничтожает ДНК, производимую DRT3, не давая ей накапливаться. RecBCD сам по себе — часть антивирусной защиты бактерии: он разрушает чужеродную вирусную ДНК. Некоторые вирусы в ответ производят белки, которые отключают RecBCD.
«Вирус пытается вывести из строя RecBCD, потому что RecBCD — важная антивирусная защита, — объяснил Стернберг. — Но, отключая его, вирус невольно снимает тормоз с DRT3».
Когда ДНК, произведённая DRT3, начинает накапливаться, бактерия перестаёт расти. А это, в свою очередь, мешает вирусу эффективно размножаться. Клетка жертвует собой, чтобы не дать вирусу распространиться на соседние бактерии.
Как именно DRT3 останавливает рост бактерии, ещё предстоит выяснить. Исследователи также хотят проверить, способны ли похожие системы создавать другие последовательности ДНК.
Начало большого поиска
Стернберг подозревает, что DRT3b — лишь верхушка айсберга. Вряд ли это единственный фермент, способный на такой нестандартный синтез ДНК. Возможно, существуют и другие белки, использующие аминокислотный шаблон, но это ещё предстоит показать.
«В более широком смысле я думаю, что в бактериальных иммунных системах скрыто огромное количество неизученной энзимологии», — добавил он.
Открытие перекликается с другими недавними находками, которые ломают привычные представления о ДНК. Мы уже писали, например, о том, что ДНК узнаёт своих на расстоянии — без химических сигналов, а также о том, что ДНК меняется с возрастом без мутаций. Теперь к списку загадок добавился и обратный поток информации — от белка к ДНК.
Если природа действительно изобрела такой механизм не один раз, нас могут ждать новые сюрпризы. Вопрос лишь в том, сколько ещё необычных способов записи генетической информации прячется в микробном мире — и какие из них мы сумеем разглядеть следующими.
Лента
В китовой туше нашли червей, которые бурят кость и живут без света
Бизоны в центре, лошади вправо: пещерная живопись оказалась кодом
Бактерии оставляют в кишечнике память, которая защищает от воспаления
Апофис может врезаться в наш космический мусор в 2029 году
Аккордеон подсказал, как воспроизвести кровоток сердца: чип прожил 60 дней
Комментарии0
Комментарии доступны после входа в аккаунт.
Войти и комментировать →Пока нет комментариев — будьте первым.