Фамилия Абылсайнова — женская форма фамилии Абылсайнов, и её разумнее рассматривать в мужском варианте, так как именно он хранит словообразовательную историю. С первого взгляда бросается в глаза необычный для русской модели суффикс -ов, прикреплённый к основе, которая звучит совершенно не по-славянски. Это верный признак того, что фамилия тюркского происхождения, скорее всего, казахского или киргизского.

Основа «Абылсайн» — это составное имя. Первая часть, «Абыл», восходит к арабскому имени Абдулла (в тюркской огласовке — Абыл, Абдул), означающему «раб Аллаха» или «слуга Всевышнего». Вторая часть, «Сайн», — это тюркское слово, которое значит «хороший», «добрый», «благой». Таким образом, имя Абылсайн можно перевести как «благой раб Аллаха» или «хороший слуга Божий». Это типичная для мусульманского мира двухкомпонентная антропонимическая модель, где к теофорному имени добавляется эпитет.

Фамилия образована по классической для славянской среды схеме: к имени отца (Абылсайн) добавили суффикс -ов, указывающий на принадлежность. В результате Абылсайнов — это «сын Абылсайна», «из рода Абылсайна». Такая модель массово закреплялась у народов Средней Азии и Казахстана в XIX–XX веках, когда царская администрация, а затем и советская власть вводили фамилии по русскому образцу. Носители фамилии — это потомки человека по имени Абылсайн, который жил, скорее всего, в степных регионах современного Казахстана или Киргизии.

С точки зрения географии, фамилия Абылсайнова — редкая. Она почти не встречается в центральной России и сосредоточена в южных регионах бывшего СССР, особенно в Казахстане. Встречаются варианты написания с одной «н» — Абылсайова или с «ы» на конце основы в мужском роде — Абылсайынов, но основной вариант закрепился именно как Абылсайнов. Социальный слой предков — крестьяне-скотоводы или ремесленники, поскольку фамилии такого типа не были дворянскими, а давались по имени отца-основателя рода.