Фамилия Афафппыов, скорее всего, не существует в том виде, в котором вы её видите. В русской ономастике не зафиксировано ни одной фамилии с таким сочетанием звуков. Ни в словаре Б. Унбегауна, ни в работах В. Никонова или С. Веселовского нет корня «Афаф-» или суффиксальной модели с «ыо». Поэтому первая и самая правдоподобная версия — перед нами опечатка, результат неверной записи со слуха или искажение при переписывании.

Если не считать это случайным набором символов, попробуем разобрать словообразовательную модель. Суффикс -ов в русских фамилиях обычно присоединяется к основе, оканчивающейся на твёрдый согласный: Петров, Иванов, Смирнов. В «Афафппыов» основа заканчивается на «ы», что для такой модели нетипично. Это ещё один признак того, что исходное слово было записано с грубой ошибкой.

Самая реалистичная гипотеза — фамилия возникла из хорошо известной «Афанасьев» или её просторечного варианта «Афанасьёв». При неразборчивом почерке или при передаче через устную речь (особенно если писарь не был грамотен) «Афанасьев» мог превратиться в «Афафппыов»: буква «н» перешла в «ф», мягкий знак и «е» слились в «пп», а окончание «-ев» исказилось до «-ыов». Такое встречалось в канцелярской практике XIX века, когда фамилии записывали на слух в непривычной диалектной среде.

Таким образом, для носителя фамилии Афафппыов главный совет — не пытаться искать корни в этом написании, а восстановить исходную форму. Проверьте метрические книги, ревизские сказки или обратитесь к профессиональному генеалогу. С высокой вероятностью ваши предки носили фамилию Афанасьев или один из её региональных вариантов. Именно с этого стоит начинать поиск истории рода.