Фамилия Афеденёв — одна из тех, где за необычным звучанием скрывается простое, но рискованное прозвище. В её основе лежит слово «афедрон» (или «афендрон»), которое в просторечии и диалектах обозначало задний проход. Слово греческого происхождения (aphédron) пришло в русский язык через медицинскую и церковную лексику, но в народе закрепилось как прямое и грубоватое обозначение. Прозвище Афеден (или Афедрён) давали либо человеку с заметной особенностью, связанной с этой частью тела, либо тому, кто часто употреблял это слово в речи.

Фамилию образовали по типичной патронимической модели: суффикс -ёв присоединялся к основам на мягкий согласный или шипящий. В данном случае он стоит после -н-, ударение падает на окончание — Афеденёв. Формально это значит «сын Афеденя», но сам Афедень — не имя, а прозвище, причём настолько редкое, что его нет в словаре русских фамилий Б. Унбегауна. Отсутствие в академических справочниках говорит о том, что фамилия локальная, вероятно, крестьянская или однодворческая.

Географически Афеденёвы встречаются преимущественно в центральных и южных областях России, особенно в Воронежской и Ростовской. Это указывает на среду чернозёмного крестьянства, где язык был прямее, а прозвища — меткими и нестеснительными. В XIX веке такие фамилии нередко закреплялись среди однодворцев — потомков служилых людей, которые не были крепостными и могли сохранять архаичные и неблагозвучные прозвища в официальных записях.

Есть и другая версия происхождения. В некоторых говорах «афедрон» означал не только часть тела, но и «заднюю часть чего-либо» — например, отдалённое место в лесу или глухой овраг. Если предок Афеденёв жил на отшибе, в таком «афедроне», прозвище могло быть топографическим, а не анатомическим. Эта гипотеза менее вероятна, но полностью её отбрасывать не стоит: народная речь часто переносила названия частей тела на предметы и места по сходству положения.

Других однокоренных фамилий — вроде Афедров или Афендронов — в русском ономастиконе практически нет. Это делает Афеденёва уникальным случаем: фамилия не размножилась через стандартные варианты, а осталась редкой и узколокальной. По архивным данным, например, из метрических книг Воронежской губернии, носители её были в основном крестьянами и мещанами, дворянских ветвей не обнаружено.

Так что фамилия Афеденёв — не книжная и не дворянская, а народная, возникшая из прямого прозвища. Она не связана с именами или профессиями, а целиком обязана своим происхождением живой разговорной речи, где меткое слово могло стать фамильным на века.