Фамилия Афилашвили — яркий пример грузинской модели фамилий, и её разговор стоит начать именно с суффикса. Окончание -швили (в русской передаче часто -швили) переводится с грузинского как «дитя» или «сын». Вместе с более древним суффиксом -дзе («рождённый») это самый распространённый способ образовывать грузинские фамилии, причём -швили исторически считался показателем восточных областей Грузии — Кахетии и Картли.

Основа «Афила» — куда более редкая и запутанная. Прямого грузинского слова с таким значением нет. Самая вероятная версия: это искажённая или адаптированная на грузинской почве форма греческого имени Филипп (в его краткой форме Фила). Греческое влияние на грузинскую ономастику было сильным, особенно в прибрежных и торговых регионах. Имя Фила (или Филипп) могло сначала превратиться в грузинское прозвище Афила (с характерным для заимствований добавлением начального «а»), а затем — в фамилию.

Другая, менее популярная гипотеза связывает основу с арабским словом «афиль» (знатный, высокопоставленный), но это маловероятно для крестьянской среды, где и зарождались фамилии на -швили. Чаще всего такие фамилии фиксировали не титул, а имя отца или его личную примету.

В современной Грузии фамилия Афилашвили встречается редко, что указывает на её локальное происхождение — возможно, из одного села или рода. Носители фамилии, скорее всего, потомки человека по прозвищу Афила, которого так назвали либо в честь греческого святого (например, святого Филиппа), либо за какое-то сходство с греком-торговцем или священником. Фамилия не несёт сословной нагрузки: она могла принадлежать и крестьянину, и ремесленнику, и священнику — важно лишь, что её носитель был «сыном того самого Афилы».