Фамилия Агамерьянц — редкий для русского слуха пример армянской фамилии с окончанием -янц. В отличие от массовых фамилий на -ян (Агамерян, Агамалян), форма на -янц указывает на принадлежность к определённой ветви рода или на происхождение из конкретной местности. Суффикс -янц — это старый родительный падеж множественного числа, буквально «из рода Агамерянов». Такие фамилии чаще встречались у армян, живших на территории Российской империи, особенно в Нахичевани-на-Дону (современный Ростов-на-Дону) и в Крыму, где армянские общины оформляли фамилии по русской бюрократической модели, но сохраняли армянскую основу.

Основа фамилии — личное имя Агамер (или Агамир). Оно составное: первая часть «ага» — тюркское заимствование, означающее «господин», «старший», «хозяин». Вторая часть — «мер» или «мир» — восходит к арабскому «амир» (князь, повелитель) или к армянскому «мер» (человек). В армянской традиции имя Агамер нередко давали в честь деда или уважаемого старейшины, подчёркивая его главенство в роду. Таким образом, Агамерьянц — это «потомок господина Агамера» или «из рода старшего».

Географически фамилия тяготеет к югу России и Закавказью. В дореволюционных метрических книгах Агамерьянцы встречаются среди армянского купечества и ремесленников Ростова-на-Дону, а также в сёлах Ширакской области (современная Армения). В советское время фамилия почти не меняла написания, хотя в паспортах иногда путали -янц и -янц, что порождало варианты Агамерянц (с одной «ц»).

Спорных версий происхождения немного. Иногда основу связывают с персидским «ага» (господин) и «мар» (змея), но это натяжка: имя Агамер в армянских источниках не имеет змеиной символики. Правдоподобнее версия с тюркско-арабским «ага-амир» — так называли сельских старшин или мелких землевладельцев.

Носителей фамилии мало, и в открытых источниках нет громких исторических личностей с такой фамилией. Но это не делает её менее показательной: Агамерьянц — живой пример того, как армянская фамилия вобрала в себя тюркский титул, арабский корень и русский суффикс, отразив многовековое переплетение культур на Кавказе и юге России.