Фамилия Аилеру — редкая и нехарактерная для русского языка по своему звуковому облику. Её происхождение почти наверняка нерусское, и при попытке разобрать её по правилам славянской ономастики мы сталкиваемся с отсутствием привычных суффиксов (-ов, -ин, -ский). Основа «Аилер-» не имеет корней в древнерусских именах или прозвищах, а окончание на -у указывает на иноязычное заимствование.

Наиболее вероятная версия — фамилия восходит к тюркским или кавказским языкам. В ряде тюркских наречий корень «ай» означает «луна» или «месяц», а «лер» — аффикс множественности. Таким образом, «Аилер» могло быть прозвищем или родовым именем со значением «лунные» или «относящиеся к луне». В таком случае фамилия Аилеру — это русифицированная форма, где окончание -у могло появиться при передаче через русскую документацию (сравните: фамилии типа Ахметов, но в бесписьменной среде фиксировали как Ахмету). Другая гипотеза связывает фамилию с молдавским или румынским словом «ailer» (устар. «крыло»), но это менее правдоподобно, так как в румынской ономастике фамилии на -у встречаются, но основа «аилер» там не засвидетельствована.

Географически фамилия Аилеру могла закрепиться в среде народов Северного Кавказа или Поволжья, где русские чиновники при переписи записывали прозвища на слух, добавляя характерные окончания. Встречается она крайне редко, что говорит о локальном происхождении и, возможно, единичном роде. Сословно предки носителя фамилии, скорее всего, были крестьянами или казаками, так как дворянские роды с такими основами в гербовниках не значатся.

Социальный контекст фамилии Аилеру — это типичный случай адаптации иноязычного имени в русской среде. Носитель этой фамилии может иметь предков из тюркоязычных или кавказских народов, которые в XVIII–XIX веках попали в зону русского административного учёта. Единственная деталь, которая отличает эту фамилию от десятков похожих (Айлер, Айларов), — это именно окончание -у, которое могло сохраниться как архаичная форма родительного падежа в местных говорах, но это лишь гипотеза.