Фамилия Аилеру — одна из тех, что сразу выдают нерусское происхождение. В русской ономастике нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, а окончание на -у звучит инородно. Основа «Аилер-» не прослеживается ни в древнерусских именах, ни в прозвищах. Чтобы понять её корни, нужно выйти за пределы славянской языковой традиции.

Самая убедительная версия отсылает к тюркским языкам. Корень «ай» означает «луна» или «месяц», а «лер» — аффикс множественного числа. Вместе «Аилер» могло быть родовым именем или прозвищем со значением «лунные» или «те, кто связан с луной». Окончание -у, скорее всего, появилось при русификации: когда русские чиновники записывали иноязычное имя на слух, они могли добавить характерное окончание, как это бывало с фамилиями вроде Ахмету (сравните с более привычной формой Ахметов). Есть и другая гипотеза — связь с молдавским или румынским словом «ailer» (устар. «крыло»), но она слабее: в румынской ономастике фамилии на -у встречаются, но основа «аилер» там не зафиксирована.

Географически фамилия могла закрепиться на Северном Кавказе или в Поволжье — регионах, где русские переписчики сталкивались с тюркоязычным населением и адаптировали местные имена под свои шаблоны. Встречается Аилеру крайне редко, что указывает на локальное происхождение, возможно, в пределах одного рода. Сословно предки носителя, скорее всего, были крестьянами или казаками: в дворянских гербовниках такая основа не значится.

Социальный контекст фамилии — это типичный случай адаптации иноязычного имени в русской среде XVIII–XIX веков. Носитель фамилии может иметь предков из тюркоязычных или кавказских народов, которые попали в зону русского административного учёта. Единственная деталь, отличающая Аилеру от похожих фамилий (Айлер, Айларов), — это окончание -у. Возможно, оно сохранилось как архаичная форма родительного падежа в местных говорах, но это лишь гипотеза, не подтверждённая документально.