Фамилия Аиперьт — редчайший случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели русских фамилий: нет суффиксов -ов, -ин, -ский, нет окончания, типичного для прилагательного. По всем признакам перед нами не исконно русская фамилия, а транслитерация или адаптация иноязычной.

Скорее всего, Аиперьт — это немецкая или еврейская (ашкеназская) фамилия, записанная кириллицей. Наибольшее правдоподобие имеет версия происхождения от немецкого слова «Eppert» или «Epprecht». В немецкой ономастике это вариант имени Эберхард (Eberhard), где первая часть «eber» — «кабан», а вторая «hart» — «сильный, твёрдый». В русской передаче через «Аи-» вместо «Э-» могла возникнуть из-за особенностей произношения или записи в паспортном столе. Вторая версия — от фамилии Айперт (Eipert), которая в свою очередь восходит к личному имени Айгерт (древневерхненемецкое Agihard — «острие меча» + «сильный»).

Фамилия Аиперьт могла появиться у потомков немецких колонистов, приглашённых в Россию в XVIII–XIX веках, или у еврейского населения черты оседлости (западные губернии), где немецкие фамилии нередко адаптировали под местное произношение. В любом случае, это не прозвище по ремеслу или внешности, а фамилия, образованная от личного имени предка. Носители такой фамилии в России — единицы, и география её, скорее всего, локальна (Поволжье, Сибирь или юг Украины — в местах поселения немцев).