Фамилия Ахайанян (арм. Ահաջանյան) — это родовое имя, или «азганун», указывающее на принадлежность к определённому клану. В её основе лежит мужское мусульманское имя Агаджан, которое при заимствовании в армянскую среду изменило звучание: начальное «а» перешло в «аха», что характерно для некоторых диалектов. Имя это сложное, восточного происхождения, и его разбор даёт ключ к пониманию фамилии.

Первая часть имени восходит к древнетюркскому слову «ага» — «хозяин, владелец», «господин, глава». Вторая часть — тюркское «джан» (от персидского جان), означающее «душа, дух»; в переносном смысле — «близкий, дорогой, как душа». Один из вариантов перевода цельного имени — «властная душа». Однако в восточной антропонимии такие сложные имена часто носили пожелательный характер: родители могли назвать сына Агаджаном, желая ему стать уважаемым и душевно щедрым человеком.

Фамилия образована по армянской модели с помощью патронимического суффикса -ян, который заменяет более древний -янц и означает «принадлежащий к роду» (буквально «из рода Агаджана»). Таким образом, Ахайанян — это «потомок Агаджана». Встречаются и варианты написания: Агаджанян, Ахаджанян. Форма Ахайанян — результат диалектного смягчения или оглушения звука «дж» до «й» в некоторых говорах (особенно западноармянских или диаспоральных).

Носители фамилии исторически жили в регионах Западной Армении (в пределах Османской империи), а после геноцида армян 1915 года расселились по всему миру — в Ливане, Сирии, Франции, США и, в меньшей степени, в современной Армении. Фамилия не указывает на конкретное сословие или ремесло предков: она лишь фиксирует родовое имя, которое мог носить как крестьянин, так и ремесленник или священник.