Фамилия Ахмитенко — характерный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. Этот суффикс, буквально означавший «маленький» или «сын», в XVI–XVII веках стал главным маркером фамилий на землях Поднепровья, Слобожанщины и Запорожья. Ахмитенко — это «сын Ахмита» или «потомок Ахмита».

Основа фамилии — личное имя Ахмит. Это восточная, скорее всего тюркская или арабо-тюркская, форма имени Ахмет (Ахмад). В переводе с арабского Ахмад означает «наиболее хвальный», «достойный похвалы» — это один из эпитетов пророка Мухаммеда. В украинских и русских землях имя Ахмет бытовало в разных огласовках: Ахмет, Ахмит, Ахмат. Форма Ахмит — это результат адаптации тюркского произношения к восточнославянской фонетике, где безударный «е» переходил в «и».

Встречается и другой вариант объяснения: Ахмит могло быть не полным именем, а уменьшительной или обиходной формой от канонического крестильного имени, например, от Евфимий (в просторечии Ефим, Афим). Однако это менее вероятно, поскольку украинские фамилии на -енко от крестильных имен чаще образуются от полной основы (Ефименко, Афименко), а не от стяжённой «Ахмит». Тюркская версия выглядит убедительнее, особенно с учётом активных контактов запорожского казачества с крымскотатарским и турецким миром.

Фамилия Ахмитенко распространена в центральных и восточных областях Украины, а также на юге России — в Краснодарском крае и Ростовской области, куда потомки казаков переселялись в XVIII–XIX веках. Носители фамилии, скорее всего, происходили из казачьей среды или из крестьян, получивших фамилию по имени отца-основателя рода. Сословная принадлежность предков могла быть разной: от рядовых казаков до мещан, но единого дворянского корня у этой фамилии нет — суффикс -енко типичен для непривилегированных слоёв.