Фамилия Ахрарходжаев — редкий пример фамилии, образованной не от одного, а от двух арабских корней, слитых воедино ещё до того, как она стала наследственным именем. Её основа — сложное личное имя Ахрарходжа, которое состоит из двух частей: «Ахрар» (множественное число от арабского «хурр» — «свободный», «благородный», «независимый») и «Ходжа» (почётный титул, восходящий к персидскому «хваджа» — «господин», «хозяин», «наставник»). В мусульманском мире «ходжа» часто обозначало потомка пророка, богатого купца или духовного учителя, а «ахрар» подчёркивало высокий моральный статус. Таким образом, имя Ахрарходжа можно перевести как «благородный господин» или «свободный наставник».

Фамилия образована по русской модели притяжательных прилагательных с суффиксом -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного «дж»). Она отвечает на вопрос «чей?» и означает «принадлежащий Ахрарходже» или «потомок Ахрарходжи». Формант -ев типичен для фамилий, которые формировались у тюркских и иранских народов Российской империи в XIX — начале XX века, когда в официальные документы вносили отчество, превращая его в наследственную фамилию. В данном случае это характерно для узбекской, таджикской или, реже, уйгурской среды, где имя Ахрарходжа было распространено среди духовенства или купечества.

Географически фамилия почти целиком привязана к Узбекистану и прилегающим районам Таджикистана. Встречаемость за пределами Средней Азии — единичная, результат миграции XX века. Предки носителя фамилии с высокой вероятностью принадлежали к сословию «ходжей» — потомков исламских проповедников или состоятельных горожан, для которых имя Ахрарходжа было не просто именем, а маркером социального статуса. Судя по конструкции, это не прозвище по ремеслу или внешности, а именно именование по предку, носившему престижное составное имя.

С точки зрения словообразования, фамилия Ахрарходжаев стоит в одном ряду с такими редкими среднеазиатскими фамилиями, как Ахраров или Ходжаев, но отличается именно двойной основой. В ней нет тюркских суффиксов, только арабские корни и русский фамильный формант — что делает её ярким свидетельством сложных языковых контактов на территории бывшего Туркестана.