Фамилия Акпекова — женская форма от Акпеков, а та, в свою очередь, образована от мужского имени или прозвища Акпек. Разбор ведёт нас в тюркскую языковую среду, скорее всего, в казахскую, ногайскую или карачаево-балкарскую. Основа — тюркское «ак» («белый», «чистый», «светлый»), вторая часть «пек» (или «бек») — титул «господин», «князь», «вождь». В сумме Акпек означает «белый бек» или «светлый господин». Однако прямое значение не обязательно указывало на реальный титул: в кочевых обществах «бек» могло быть частью личного имени, пожеланием ребёнку стать уважаемым и знатным. «Ак» же нередко использовалось в значении «чистый помыслами», «праведный». Таким образом, Акпек — составное антропонимическое имя-пожелание, которое впоследствии закрепилось как фамилия.

Стоит рассмотреть и альтернативную трактовку, которую часто упускают. В некоторых тюркских языках «пек» может быть не титулом, а формой слова «крепкий», «сильный» (сравните с турецким pek — «очень», «крепко»). Тогда Акпек можно прочитать как «очень белый» или «крепко-белый» — возможно, прозвище светлокожего или седого человека. Но эта версия менее вероятна: титул «бек» в составе имён настолько распространён в регионе, что именно он здесь первичен.

Суффикс «-ов/-ев» в фамилии — типично русский патронимический формант, который в XIX–XX веках массово добавляли к тюркским основам при документировании. Это не значит, что носительницы фамилии — русские по происхождению. Скорее, это результат административного оформления: при записи в метрики или советские паспорта к тюркскому имени пришили стандартный русский суффикс принадлежности. Географически фамилия Акпекова встречается в регионах, где исторически проживали тюркские народы: в Казахстане, в республиках Северного Кавказа (особенно в Карачаево-Черкесии и Кабардино-Балкарии), а также среди ногайцев Ставрополья. В русских документах она фиксируется редко и почти всегда указывает на тюркские корни семьи.