Фамилия Алинчиев — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа — Алинчий — не встречается в современных именах и прозвищах, что заставляет искать корни в диалектах, искажённых формах или тюркских заимствованиях.

Самый вероятный путь — от мужского имени Алим или Алий (арабское «знающий», «учёный») с добавлением тюркского уменьшительно-ласкательного суффикса -чи. В таком случае Алинчий — это «маленький Алим», «сын Алима». Суффикс -ев в фамилии (а не -ов) указывает на основу, оканчивающуюся на мягкий согласный или й: Алинчий → Алинчиев. Такая модель характерна для русских фамилий, образованных от имён или прозвищ тюркского происхождения, особенно в регионах со смешанным населением — Поволжье, Приуралье, Северный Кавказ.

Менее убедительная версия — от тюркского слова «алын» (лоб, перед) с тем же суффиксальным оформлением. Тогда Алинчий — прозвище человека с приметным лбом или того, кто шёл впереди. Но эта гипотеза слабее: в тюркских языках прилагательные редко образуют прозвища с -чи, а сама фамилия не фиксируется в ономастических справочниках как распространённая, что говорит о её локальном, почти единичном бытовании.

С точки зрения словообразования, Алинчиев стоит в ряду фамилий типа Алимчиев, Алиев, Алимов, но отличается редким суффиксом -чий, который в русской среде почти не встречается. Это позволяет предположить, что фамилию могли принести переселенцы из Азербайджана, Дагестана или Средней Азии, где -чи — продуктивный аффикс, а затем адаптировать по русской модели. Сословная принадлежность предков неясна: фамилия не даёт намёков на дворянство или духовенство, скорее на крестьянское или мещанское происхождение, но точных исторических записей об Алинчиевых нет.