Фамилия Алокушп — один из тех редких случаев, когда написание почти дословно сохранило исходное прозвище. В ней нет привычного фамильного суффикса (-ов, -ин, -ский), который в русском языке обычно присоединяется к основе. Перед нами, скорее всего, застывшая форма прозвища, которое не успело или не захотело обрасти типовым окончанием. Такое встречается в среде, где фамилии складывались поздно и стихийно, — например, у однодворцев южных областей, у казачества или в прибалтийско-немецких и финских анклавах.

Сам корень «алокушп» не имеет очевидной славянской этимологии. Вероятнее всего, это искажённое или адаптированное на русской почве заимствование. Можно предположить связь с немецким «allzu» (слишком) и «Kuppe» (верхушка, купол) или с топонимом типа Altenkirchen. Но более правдоподобно, что основа восходит к балтийским или финно-угорским языкам. В эстонском, например, есть слово «alukas» (низкий, нижний) и «küpp» (ухаб, горб), что вместе могло означать «низкий холм» или «живущий под горбом» — то есть топографическое прозвище по месту жительства. В латышском «alus» — пиво, а «kupis» — куча; «пивная куча» звучит как прозвище содержателя пивной или неряхи.

География фамилии крайне узкая. Единичные носители встречаются в Псковской области, в Латгалии и в среде староверов, переселившихся в Прибалтику в XVII–XVIII веках. Поэтому наиболее вероятная версия — фамилия Алокушп возникла в среде латгальских или эстонских крестьян, чью фамилию при переписи записали на слух, не переделывая на русский лад. Предок мог быть прозван по местности или по занятию: например, «алоку шп» (от латг. «aloks» — локоть, «špats» — щель) — плотник или столяр-краснодеревщик.

Фамилия не склоняется в мужском роде, что дополнительно указывает на её нерусское происхождение. Встречаются варианты написания с одной «п» (Алокуш) или с мягким знаком (Алокущп), но они ещё реже. Из-за редкости фамилии в дореволюционных метриках она почти не фиксируется — это значит, что большинство носителей были крестьянами или мещанами, не оставившими следов в родословных книгах дворянства.