Фамилия Амнепадистов — редчайший случай в русской ономастике, где прозвище, звучащее как латинская фраза, превратилось в фамилию с помощью обычного русского суффикса. Она образована от прозвища Амнепадист, а то, в свою очередь, от латинского выражения «Anno paedistis» — «В лето (от Рождества Христова) ты прошествовал» или «В год ты прошел». Скорее всего, это была шуточная или нарочито ученая кличка, которую дали человеку, любившему вставлять в речь латинские слова или каким-то образом связанному с церковным календарем и летоисчислением.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий: «чей?» — сын Амнепадиста. Форма множественного числа на -ы (Амнепадистовы) встречается реже, чем на -ы (Амнепадистовы), но в данном случае она закрепилась, возможно, из-за того, что носителей было несколько, или как дань старинной традиции обозначения целого рода.

Появление такой фамилии в России связано с духовным сословием. В семинариях XVIII–XIX веков ученикам нередко давали «искусственные» фамилии на латинской или греческой основе, чтобы выделить их из крестьянской среды или просто из-за нехватки обычных фамилий. Амнепадистов — почти наверняка семинарская фамилия, причем не из самых ходовых вроде Благонравова или Любомудрова, а редкая, почти курьезная. Ее носитель мог быть выпускником духовной академии, который затем служил священником или учителем.

Географически фамилия могла закрепиться в центральных губерниях России, где были сильны духовные учебные заведения, но из-за редкости точных данных о расселении нет. Встретить ее сегодня — большая удача для генеалога. В написании возможна путаница: двойное «с» (Амнепадистов) иногда заменяли на одно, а в дореволюционных документах могли писать через «ѣ» (Амнѣпадистов), но это не меняет сути.