Фамилия Анеева — женская форма, парная к мужской Анеев. Её основа — имя или прозвище Аней, которое, скорее всего, восходит к тюркскому слову «ана» — мать. Суффикс -ев в русской патронимической модели указывает на принадлежность: Анеев буквально значит «сын Анея» или «из рода Анея». Это типичная конструкция для русских фамилий, но с нерусским, тюркским корнем.

Аней могло быть ласкательным именем для ребёнка, особенно в семьях, где мать играла ключевую роль, или прозвищем заботливого, «материнского» по характеру человека. По другой версии, Аней — это вариант имени Анай, распространённого у башкир, татар и других тюркских народов. В таком случае фамилия прямо указывает на этническое происхождение предка.

География фамилии Анеева сегодня сосредоточена в Поволжье и на Урале — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области. Это плотно привязывает её к тюркской среде. В документах XVIII–XIX веков носители фамилии чаще всего числились государственными крестьянами или тептярями — сословием, близким к башкирам и татарам.

Редкая деталь: в некоторых переписях XIX века фамилию записывали через «я» — Аняев. Это не ошибка, а отражение местного произношения: в тюркских говорах «а» после мягкого согласного звучит как «я». Со временем написание унифицировалось, но вариант Аняев встречается до сих пор, особенно в Башкортостане.

Спорных гипотез немного. Иногда Анеева связывают с греческим именем Аней (мифологический царь), но это натяжка: фамилия слишком плотно привязана к Поволжью, чтобы предполагать античное происхождение. Правдоподобнее тюркская версия — она подкреплена и географией, и словообразовательной моделью.