Фамилия Анерт имеет немецкие корни и восходит к фамилии Анер. В её основе лежит немецкое слово «Ahn», которое переводится как «болото». С помощью суффикса -er, указывающего на принадлежность к местности или роду занятий, образовалось прозвище Анер — то есть «житель болота». Таким образом, первый носитель фамилии, вероятно, обитал в болотистой или сырой местности.

Интересная особенность этой фамилии — появление конечной буквы «т». В исходной форме Анер её нет. Исчезновение или, наоборот, добавление «т» — не редкость для исторических изменений в языке. В случае с фамилией Анерт, скорее всего, произошло наращение «т» под влиянием диалектного произношения или как вариант адаптации фамилии в новой языковой среде. Похожий процесс можно наблюдать и в других немецких фамилиях, где к основе добавлялся дополнительный согласный звук для благозвучия или под влиянием местных говоров.

Словообразовательная модель здесь проста: основа «анер» (человек из болота) плюс конечное «т», закрепившееся в написании. Фамилия относится к группе «топографических» прозвищ, которые давали по характерной примете места жительства. Такие фамилии часто возникали стихийно и не имели отношения к сословной принадлежности — их могли носить и крестьяне, и ремесленники, жившие в схожих природных условиях.

Встречается фамилия Анерт преимущественно в Германии и среди потомков немецких переселенцев, в том числе в России (например, у поволжских немцев). В ономастических справочниках её нередко связывают именно с диалектными вариантами фамилии Анер, что подтверждает версию о «болотном» происхождении.