Фамилия Апкаликов образована от имени Апкалик, которое, скорее всего, происходит от двух тюркских корней: «ап» (от «аба» — «отец») и «калик» — «оставшийся». Судя по всему, такое имя давали ребенку, которого воспитывал только отец. Модель образования фамилии проста и типична для русской ономастики: к основе Апкалик прибавили фамильный суффикс -ов, который означает принадлежность или родство. Таким образом, Апкаликов — буквально «сын Апкалика» или потомок человека по имени Апкалик.

Само имя Апкалик встречается редко и несет на себе отпечаток бытовой ситуации в семье: если мать умерла или ушла, а дитя осталось на попечении одного отца, такое прозвище или имя закреплялось за ребенком. В тюркской среде, особенно у татар, башкир или народов Кавказа, подобные «говорящие» имена были распространены — они фиксировали обстоятельства рождения или воспитания. В этом смысле Апкалик стоит в одном ряду с такими именами, как Атабек (буквально «князь-отец») или Исхак (традиционное библейское имя, но в народной этимологии иногда связываемое с отцовством).

Фамилия Апкаликов — редкая. Она не фиксируется в массовых списках распространенных русских фамилий, а значит, скорее всего, имеет узкую географию бытования. Вероятнее всего, она встречается в регионах с тюркским населением — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области или на Северном Кавказе. Из-за редкости фамилии не стоит ожидать многочисленных известных носителей в истории, но сама по себе она ценна как живое свидетельство семейного уклада и языка предков.

Словообразовательная модель здесь проста, но показательна: суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформлялась уже в русской канцелярской традиции (при переписях, в метриках), а основа осталась тюркской. Это типично для фамилий, которые возникли на стыке культур — когда имя или прозвище переходило в официальный документ с русским окончанием.