Фамилия Апхудова — женская форма фамилии Апхудов, и её разбор стоит начать с главной загадки: корня. В русской ономастике эта фамилия почти не встречается, и её основа неочевидна для носителя славянских языков. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от прозвища или имени, пришедшего из языков Кавказа, тюркских или иранских наречий. Наиболее правдоподобная версия связывает корень «апхуд» с осетинским: «апп» — владыка, господин, и «худ» — вода. Получается «господин воды» или «владыка». Это могло быть прозвище человека, контролировавшего водные ресурсы, например, арыки или родники в горной общине. Вторая версия — связь с арабским «абу» (отец) и искажённым именем — маловероятна: тогда фамилия звучала бы как Абухудова, а не Апхудова.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов- указывает на принадлежность, то есть Апхудов — потомок человека по прозвищу или имени Апхуд. Окончание -а в женском варианте — стандартная русская адаптация. Географически фамилия тяготеет к Северному Кавказу и Закавказью, где такие корни органичны, но могла попасть и в центральную Россию через переселенцев или смешанные браки.

Если отбросить домыслы, то самое надёжное — признать, что фамилия редкая и её точная этимология утеряна. В словарях Б. Унбегауна или В. Никонова она не фигурирует, что говорит о её локальном бытовании, возможно, в пределах одного села или рода. Фамилия не даёт сословной привязки: её могли носить и крестьяне, и князья — без дополнительных документов сказать нельзя. Единственное, что можно утверждать с уверенностью: перед нами не славянская основа, а заимствование, адаптированное русским суффиксом.