Фамилия Апвкунев — редкий случай, когда написание почти полностью скрывает исходное слово. С первого взгляда она кажется тюркской или даже искусственной, но на деле перед нами искажённая запись русской фамилии, образованной от крестильного имени.

В основе лежит каноническое имя Амвкун (от греч. ἀμφι — «вокруг» и κύων — «собака»; в переносном смысле — «преданный»). В просторечии имя Амвкун часто произносили с утратой начального «А» — «Мвкун» или «Мовкун». При записи фамилии в документах XIX — начала XX века малограмотный писарь мог механически перенести начальную букву «А» вперёд, а оставшуюся часть записать на слух. Так из «Амвкунев» (отчество от Амвкун) получилось «Апвкунев». Звук «м» перед глухим «в» оглушился в «п», что и закрепилось на письме.

Суффикс -ев указывает на модель «чей?» — сын или потомок человека по имени Амвкун. Фамилия типична для северных и центральных губерний России, где имя Амвкун, хоть и редко, но встречалось среди крестьян и духовенства. Сословно — скорее всего, крестьянская или мещанская, поскольку у дворян и купцов такие искажения при записи исправляли.

Других версий происхождения у фамилии нет. Попытки вывести её из тюркских корней (например, от «ап» — охота или «кун» — день) разбиваются о суффикс -ев, который в русском языке почти всегда указывает на отчество, а не на прозвище. Географически фамилия привязана к регионам, где имя Амвкун ещё бытовало в народной среде, — например, к Архангельской и Вологодской губерниям.

Сегодня носители фамилии Апвкунев — это потомки тех, чьё имя предка писарь записал с ошибкой, а исправлять её в метриках уже не стали. Фамилия — живой свидетель того, как устная речь и канцелярская небрежность создают уникальные словоформы.