Фамилия Ардунатий звучит непривычно для русского уха, и это не случайно: она почти наверняка нерусская по происхождению. Её основа и суффикс выдают иноязычные корни, скорее всего, южнославянские или румынские. В русской традиции фамилии на -ий обычно либо книжные (церковнославянские, типа Благовещенский), либо заимствованные. Ардунатий — случай второго типа.

Разберём основу. «Ардуна» или «Ардун» — это не русское слово. Вероятнее всего, перед нами румынская (или молдавская) фамилия, образованная от личного имени или прозвища. В румынском языке существует имя Ardelean (означает «трансильванец», от Ardeal — Трансильвания), но звуковой переход в «Ардунатий» маловероятен. Более правдоподобна связь с румынским словом «ardei» — «перец», или с глаголом «arde» — «гореть, жечь». Тогда прозвище Ardun могло означать «жгучий», «горячий» (по характеру) или относиться к человеку, который работал с огнём: кузнецу, печнику, обжигальщику угля.

Суффикс -ати (-ati) в румынских фамилиях — типичный показатель принадлежности, аналог русского -ов/-ев. То есть Ардунатий — это «сын Ардуна» или «из рода Ардуна». В русском языке фамилия могла быть адаптирована под славянское окончание -ий, что делало её более «книжной» и благозвучной для бюрократии XIX века.

Географически такая фамилия должна быть редкой, с концентрацией в Бессарабии (историческая область на стыке Молдовы и Украины), на Буковине или у румынских переселенцев на юге России. Встречается она и в современной Румынии, где вариант Ardunateanu или Ardunăţeanu более распространён, чем краткая форма. Если у вас фамилия Ардунатий, скорее всего, ваши предки происходили из румыноязычной среды, где их звали «Ардун», а после переселения в Российскую империю или при записи в метрические книги фамилия получила привычное для чиновников окончание.