Фамилия Арнюскина — редкий случай, когда происхождение почти наверняка привязано к одной точке на карте. В основе лежит не имя и не ремесло, а топоним, и это сразу задаёт направление поиска.

Корень «Арнюск-» прямо указывает на реку Арнюска (приток Ветлуги в Нижегородской области) или на деревню, стоявшую на её берегах. Такие фамилии, образованные от названий малых рек и селений, типичны для севера и северо-востока России, где в XVI–XVII веках активно шло заселение: человек, перебравшийся из Арнюски в другое село, получал прозвище Арнюсок или Арнюска — «тот, кто с Арнюски». Суффикс -ин в фамилии отвечает на вопрос «чей?»: Арнюскин — значит из семьи Арнюски.

Сам гидроним Арнюска, скорее всего, финно-угорского происхождения, как и многие названия в Заволжье. Можно вспомнить марийское «арня» (неделя) или «ар» (река, поток). Версия, что фамилия пошла от личного прозвища Арнюска — уменьшительной формы от редкого крестильного имени вроде Арсения или Арнольда, — имеет право на существование. Но в таком случае география фамилии была бы шире, а она, судя по данным переписей, сосредоточена именно в Нижегородской и соседних областях. Поэтому топонимическая версия остаётся основной.

Форма Арнюскина — женский вариант фамилии (в мужском роде — Арнюскин). Носительница этой фамилии, скорее всего, потомок крестьян или однодворцев из-под Ветлуги, которые в XVIII–XIX веках сохраняли привязку к родной реке в своём родовом имени.