Фамилия Атмалкина — женская форма фамилии Атмалкин, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Атмалка. Основа фамилии неочевидна на первый взгляд, и здесь мы сталкиваемся с двумя основными версиями, одна из которых заметно правдоподобнее другой.

Первая и самая вероятная версия отсылает к тюркским корням. Слово «атма» в ряде тюркских языков (татарском, башкирском, казахском) означает «стрельба», «выстрел» или «метание». Суффикс «-лка» в русских говорах и в заимствованиях часто образовывал названия орудий действия или предметов (ср. «веялка», «сеялка»). Таким образом, Атмалка — это прозвище меткого стрелка из лука или человека, который изготавливал стрелы. В Поволжье и на Урале, где татарское и русское население веками жило рядом, такие прозвища легко переходили в русские фамилии через суффикс принадлежности «-ин». Атмалкины могли быть потомками искусного лучника или охотника.

Вторая версия, более спорная, связывает фамилию с греческим словом «атма» (ἅτμα) — «пар», «дыхание», или с санскритским «атман» — «душа». Эта гипотеза красива, но лингвистически слаба: фамилия с суффиксом «-ин» и окончанием «-а» характерна для восточноевропейской, а не для южной или индийской традиции. Скорее всего, это случайное созвучие, которое не подтверждается географией фамилии.

Интересно, что фамилия Атмалкина встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, особенно в Ростовской области и на Кубани. Это косвенно подтверждает тюркскую версию: казачьи области исторически впитывали прозвища от соседних народов. Фамилия не относится к числу дворянских или старых боярских — её носителями были, скорее всего, крестьяне или казаки, получившие прозвище по личному качеству или ремеслу. Суффикс «-ин» указывает на то, что основатель рода был известен в своей общине именно как Атмалка, а его потомков называли «чьи? — Атмалкины».