Фамилия Атонисьянц интересна уже своей формой: окончание -янц, а не более привычное -ян, сразу выдает её армянское происхождение и при этом указывает на определённый регион. В армянском языке суффикс -янц (как и -ян) означает «из рода такого-то» или «потомок», но форма с конечным -ц исторически была характерна для западных областей исторической Армении — района Вана, Киликии. Именно там такие фамилии чаще попадали в русскую письменность до массовой русификации армянских фамилий в советское время, когда -янц обычно заменяли на -ян. Так что фамилия Атонисьянц — своего рода диалектный или хронологический маркер: она сохранила более архаичный вариант записи.

Основа фамилии — Атонис. Это редкое личное имя, которого нет в списках распространённых армянских имён. Скорее всего, перед нами местная фонетическая адаптация христианского имени Антоний (в армянской традиции — Антонос) или Антонин. Переход «н» в «нс» на стыке с гласным — явление нередкое при заимствовании имён через разговорную речь. Таким образом, Атонисьянц — патронимическая фамилия, буквально «потомок Атониса», то есть человека, которого звали Антонием, но на местный лад.

О сословном происхождении носителей фамилии можно судить лишь косвенно. В дореволюционных документах фамилия не встречается среди дворянских родовых списков, а её редкость и локальный характер указывают на то, что предки, вероятно, относились к ремесленникам или мелким торговцам из армянской диаспоры. В XIX веке такие семьи переселялись на юг Российской империи — на Кубань, в Ставрополье, в Крым, где и могла закрепиться форма Атонисьянц.

Никаких сведений о знаменитых носителях фамилии в открытых источниках нет — это подчёркивает её редкость. Если ваши предки носили эту фамилию, вы имеете дело с узкой семейной ветвью, сохранившей в написании память о западном армянском диалекте и о человеке по имени Атонис.