Фамилия Атожанов — редкая, и её происхождение напрямую связано с тюркскими языками и мусульманской традицией имён. Разберём её по частям, чтобы понять, кем могли быть предки. В основе лежит имя Атожан — типичное для казахской антропонимии, которое состоит из двух корней. Первый — «ато», восходящий к тюркскому «ата» («отец», «предок», «дед»). В казахском, киргизском и других языках это слово входит в состав уважительных обращений, подчёркивая почтение к старшим или родовую связь. Второй корень — «жан» (от персидского «джан» — «душа», «жизнь», «дорогой»); это распространённый компонент в мусульманских именах, придающий ласкательный или возвышенный оттенок. Имя Атожан можно перевести как «душа отца» или «дорогой, как предок», а фамилия Атожанов буквально означает «потомок Атожана».

В словообразовательном плане фамилия следует тюрко-русской модели: к основе на «-жан» добавили русский патронимический суффикс «-ов». В XIX–XX веках его массово присоединяли к тюркским именам при оформлении фамилий в документах — это типично для многих народов Средней Азии и Поволжья, попавших под влияние Российской империи. Суффикс указывает на принадлежность к роду: Атожанов — сын или внук Атожана.

Географически фамилия встречается преимущественно в Казахстане и среди казахской диаспоры, реже — у киргизов и башкир. В России её можно найти в регионах с компактным проживанием казахов — в Оренбургской, Астраханской областях, а также в Татарстане. Спорных версий происхождения у фамилии нет: имя Атожан хорошо фиксируется в ономастических справочниках. Социально носители фамилии, скорее всего, происходят из крестьян или скотоводов — в кочевой среде имена, подчёркивающие уважение к старшим, были особенно распространены.