Фамилия Атцподина — редчайший случай в русской ономастике, и её разбор требует отказа от привычных шаблонов. В ней нет ни одного типичного для русских фамилий суффикса: ни -ов, ни -ин, ни -ский. Основа заканчивается на -ин, но перед ним стоит странное сочетание «Атцпод». Это сразу наводит на мысль, что перед нами не исконно русская, а искусственная или иноязычная фамилия, переделанная на русский лад.

Скорее всего, Атцподина — это русифицированная версия немецкой или еврейской фамилии. В немецком языке сочетание «atz» часто встречается в фамилиях, оканчивающихся на -mann (например, Atzmann). Если добавить сюда компонент «под» (от нем. «Bod(e)» — земля, дно) или «пот» (от нем. «Pott» — горшок), может получиться сложная конструкция, которую при переселении в Россию переделали в единое слово. Окончание -а (женский род) и ударение, вероятно, на последний слог (АтцподинА) указывают на то, что первоначально фамилия звучала как Атцподин, а форма на -а — это запись через жену или вдову (как «жена Атцподина»).

Другая, менее вероятная версия — это канцелярская ошибка или искажение. В документах XIX века писцы часто коверкали сложные фамилии. Атцподина могла возникнуть из фамилии Отцподин (от «отец» и «под» — «под отцом», то есть младший сын?) или из фамилии Атцподов (с неверным прочтением окончания). Но в любом случае, это не крестьянская и не дворянская фамилия в классическом понимании — в России такие словоформы не образовывались естественным путём. Носители, скорее всего, были выходцами из немецких колоний или из еврейских местечек, получившими фамилию при паспортизации в XIX веке.

Если попробовать разобрать модель образования, бросается в глаза, что фамилия не вписывается ни в одну из продуктивных русских моделей. Суффикс -ин в русских фамилиях обычно присоединяется к основе, оканчивающейся на гласную или -а/-я (Петя — Петин, Кузьма — Кузьмин). Здесь же основа «Атцпод» заканчивается на твёрдый согласный, что для фамилий на -ин нетипично. Это дополнительный аргумент в пользу иноязычного происхождения: носители языка просто «дорисовали» привычное окончание к чужому корню, не заботясь о грамматической стройности.

Географически фамилия, скорее всего, привязана к регионам компактного проживания немецких колонистов (Поволжье, юг Украины) или к черте оседлости еврейского населения. В метрических книгах и ревизских сказках XIX века такие фамилии встречаются единично и часто в искажённом виде. Поиск по современным базам данных показывает, что носители фамилии Атцподина — буквально единицы, и все они, вероятно, потомки одной семьи, сохранившей редкую фамилию без изменений.