Фамилия Атукова — женская форма фамилии Атуков, и её происхождение стоит искать в мужском прозвище или имени, от которого она образована. Основа здесь — «Атук», и это слово почти наверняка имеет тюркские корни. В татарском, башкирском и других тюркских языках есть основа «ату» — «стрелять», «бить», «ударять». Соответственно, «Атук» могло быть прозвищем меткого стрелка, охотника или воина, который славился своей меткостью. Такие прозвища были распространены среди служилых татар и башкир, которые нередко переходили на русскую службу и со временем получали фамилии.

Суффикс «-ов» в мужской форме (Атуков) указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ или имён, оканчивающихся на согласный. Это буквально «сын Атука» или «из рода Атука». Женская форма, соответственно, просто добавляет окончание «-а». Важно отметить, что фамилия не является исконно русской по корню — она относится к пласту фамилий, возникших на стыке русской и тюркской культур в Поволжье, Приуралье или на южных рубежах Московского государства.

Встречается фамилия Атукова преимущественно в регионах с сильным татарским и башкирским влиянием — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Также есть вероятность, что основа могла быть связана с личным именем Атук — в прошлом у тюркских народов существовали имена с таким корнем, означающие «стрела» или «меткий». В любом случае, носительницы этой фамилии могут с большой вероятностью считать своими предками людей, имевших отношение к военному делу или охоте, а сама фамилия — яркий пример того, как тюркское прозвище прижилось в русской ономастике.