Фамилия Аусханова — редкая, и её происхождение остаётся под вопросом. Основа «Аусхан» не встречается ни в древнерусских именах, ни в крестьянских прозвищах, ни в тюркских родоплеменных названиях. Словообразовательная модель с суффиксом -ов- (в женском роде -ова) типична для русских фамилий, но сама основа указывает на иной, книжный путь возникновения. Вероятнее всего, фамилия образована от немецкой фамилии Ауссан (Aussan) или от географического названия Аусхан (например, в Австрии или Баварии). В таком случае носитель — потомок обрусевшего немца, чью фамилию русифицировали добавлением типичного русского окончания.

Менее правдоподобна, но возможна версия происхождения от арабского имени Аус (в значении «дар», «подарок») с добавлением тюркского суффикса -хан («владыка», «правитель»). Тогда Аусхан — составное имя, которое могло бытовать у народов Северного Кавказа или Поволжья, где смешивались арабская и тюркская ономастика. Однако в таком случае фамилия должна была бы писаться как Аусханова, а не Аусханова, и в реальных записях такой вариант не встречается.

География фамилии Аусханова — почти исключительно Кавказ (Чечня, Ингушетия, Дагестан). Это не противоречит версии о немецком корне: в XIX веке в регионе служили немецкие колонисты и специалисты, чьи фамилии могли адаптироваться на месте. Но более вероятно, что фамилия — результат ошибки или описки при записи более распространённой кавказской фамилии (например, Аушев или Аусов). В любом случае, точное происхождение остаётся под вопросом, и фамилия Аусханова — хороший пример того, как редкое имя может быть следствием случайности или смешения культур.