Фамилия Авркин — редкая и на первый взгляд неочевидная. Её основа — «Аврок» или «Аврка» — не встречается в современных именах и нарицательных словах, поэтому разбор требует обращения к исторической фонетике и диалектам.

Ключ к разгадке — суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — «Авркин», то есть сын или потомок человека по прозвищу Аврка. Само же прозвище Аврка — это, скорее всего, обиходная, усечённая форма крестильного имени Аверкий (от латинского «averto» — «отвращаю», в христианском контексте — «отвращающий зло»). В народной речи имя Аверкий сокращалось до Авёрка, а затем, с редукцией гласных и упрощением, до Аврка. Подобные стяжения типичны для русской антропонимии: Аверкий → Аврка → Авркин.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «авра» (суета, шум, беспокойство) или «аврить» (суетиться, делать что-то второпях). В таком случае прозвище Аврка могли дать непоседливому, суетливому человеку. Однако эта гипотеза слабее: глагол «аврить» фиксируется в основном в южнорусских говорах, а фамилия Авркин не имеет ярко выраженной региональной привязки, которая подтверждала бы такое происхождение.

Географически фамилия встречается рассеянно, без крупных гнёзд. Это указывает на то, что она возникла в разных местах независимо — везде, где имя Аверкий было в ходу и где его сократили до Аврки. В документах XVII–XVIII веков формы «Авров», «Аврин» встречаются чаще, а «Авркин» — более поздняя, патронимическая вариация, закрепившаяся именно как фамилия.

С точки зрения словообразовательной модели, Авркин стоит в ряду таких фамилий, как Фомин (от Фома), Васькин (от Васька), Савкин (от Савка). Все они образованы от обиходных форм канонических имён, и Авркин — не исключение, хотя исходное имя Аверкий сегодня почти забыто.