Фамилия Айчараков — редкий случай, когда географический адрес прямо «вшит» в основу. Её ядро — топоним Айчарак, название населённого пункта. Такие фамилии, образованные от названий сёл или деревень, обычно получали переселенцы: человек покидал родное Айчараково (или Айчарак) и на новом месте становился Айчараковым — то есть «выходцем оттуда». Модель типична для русской ономастики: на вопрос «откуда?» отвечали фамилией на -ов/-ев.

Сам топоним Айчарак, скорее всего, тюркского происхождения. В тюркских языках «ай» — луна, месяц, а «чарак» может означать «свет», «сияние» или «глаз» (в переносном смысле — «свет очей»). Вместе «Айчарак» переводится как «лунный свет» или «сияние луны» — поэтичное название, которое могли дать селу из-за красивого места или как метафору. Встречаются похожие названия в Башкортостане и Татарстане, так что географические корни фамилии, вероятно, лежат в Волго-Уральском регионе или Западной Сибири, куда переселенцы уходили в XVII–XIX веках.

Суффикс -ов указывает на русскую модель образования фамилии от тюркского корня. Это не редкость для Поволжья и Приуралья, где веками жили рядом русские и тюркские народы: фамилия могла появиться у русского крестьянина, перебравшегося из татарской или башкирской деревни, или у обрусевшего представителя местных народов.

Встречаемость фамилии низкая. Если искать Айчараковых, они окажутся в основном в Башкортостане, Челябинской и Оренбургской областях — то есть на территории исторического расселения башкир и татар. Сословно предки могли быть государственными крестьянами или казаками: именно эти группы активнее всего осваивали новые земли и закрепляли за собой прозвища по месту выхода.

Других версий, кроме топонимической, у фамилии нет. Прозвище от личного имени Айчарак (светлолицый, луноликий) теоретически возможно, но менее вероятно: такие имена в тюркской среде встречались, но фамилии от них образовывались бы с другим суффиксом (например, Айчараков от имени — скорее исключение, чем правило). Основная и самая надёжная версия — фамилия-указатель на родину.