Фамилия Айчинина — редкая и территориально привязанная, её происхождение напрямую связано с тюркскими языками и регионами Поволжья и Урала. В основе, скорее всего, лежит мужское имя или прозвище Айчин. Корень «ай» в тюркских наречиях означает «луна» или «месяц», часто использовался в составных именах как пожелание красоты, света или удачи (ср. Айдар, Айгуль, Айрат). Суффикс «-чин» мог быть как уменьшительным, так и указывать на принадлежность к определённой группе или роду.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом «-ин», который указывает на принадлежность («чей?» — Айчинина). Это характерно для фамилий, возникших в среде крещёных народов Поволжья — чувашей, татар, башкир или марийцев, где русская администрация адаптировала местные имена под привычную форму. Женская форма Айчинина говорит о том, что носительница является потомком человека по имени Айчин (или по прозвищу Айчин). Мужской вариант фамилии — Айчинин.

Слабая распространённость фамилии (она почти не встречается за пределами Чувашии и соседних областей) указывает на то, что она могла закрепиться в одном-двух селениях и не вышла за их пределы. В отличие от массовых фамилий, Айчинина не прошла через городскую «шлифовку» и сохранила связь с конкретной местной традицией имянаречения. Если предположить, что имя Айчин было не просто красивым, а прозвищным (например, от «айча» — «луноликий»), то предок мог получить его за внешность. Однако в тюркской ономастике такие имена чаще были благопожелательными, а не описательными.

Сословно носители фамилии, вероятнее всего, относились к государственным или ясачным крестьянам, так как в дворянские и купеческие роды подобные фамилии не входили. Никаких известных исторических деятелей с этой фамилией в открытых источниках не зафиксировано, что делает её ценным маркером для узкой семейной генеалогии.