Фамилия Aidukonis образована от именования Aiduk, которое, предположительно, связано с литовским словом aidas – «отголосок», «отзвук», «эхо». Вполне вероятно, основатель рода Aidukonis получил свое прозвище за громкий зычный голос или за общительность, разговорчивость. Не исключено, что фамилия Aidukonis происходит от имени Aiduk, которое представляет собой форму имени Эдуард. Имя Эдуард в переводе со староанглийского означает «богатый попечитель».