Фамилия Аймотетинова — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не профессия и не географическое название, а целое прозвище, построенное как глагольная конструкция. Это сразу отличает её от подавляющего большинства русских фамилий, образованных от существительных. Корень здесь — тюркское или кавказское слово «аймоте» или «аймотет», а суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей?» — Аймотетиновых. Окончание «-а» — женский вариант, но сама фамилия склоняется как типичная русская фамилия на -ин.

Самый вероятный источник — прозвище, которое дали человеку за манеру говорить или за постоянную фразу. В тюркских языках (особенно в кумыкском, ногайском, карачаево-балкарском) «айт» означает «скажи», «говори». Частица «моте» или «мотет» — искажённое «мута» или «муталим» (ученик, знающий). То есть «Аймотет» можно перевести как «скажи-ка, знающий» или «говорящий по-учёному». Фамилия могла закрепиться за человеком, который любил вставлять в речь книжные или назидательные выражения, или за местного грамотея, к которому обращались за советом.

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование, — связь с арабским «аманат» (залог, доверенное). В таком случае основа могла трансформироваться через диалектное произношение: «аманат» → «амантет» → «аймотет». Тогда прозвище получил тот, кто отвечал за хранение общих ценностей или был доверенным лицом. Однако эта цепочка сложнее, и «аймотет» как производное от «аманат» фиксируется реже.

Географически фамилия Аймотетинова тяготеет к Северному Кавказу и Нижнему Поволжью, где сильны тюркские языковые влияния. Встречается она в Дагестане, Чечне, а также среди астраханских и ставропольских ногайцев. В русских переписных книгах XVII–XVIII веков такая фамилия не отмечена — скорее всего, она оформилась позже, в XIX веке, когда у горских народов начали массово записывать фамилии по русскому образцу.

С точки зрения словообразования интересен суффикс «-ин», а не «-ов». В русской ономастике суффикс «-ин» чаще давали по материнской линии или от основ на -а/-я. Но у тюркских фамилий это распределение не работает: «-ин» просто стал стандартным окончанием при русификации. Поэтому Аймотетинова — не «женская» фамилия по происхождению, а обычная патронимическая, просто зафиксированная в женском роде.

Если искать однокоренные фамилии, то ближе всего Аймотеев, Айметов, Аймурзаев. Но Аймотетинова стоит особняком: у неё нет массового двойника с тем же корнем, что подчёркивает её локальный, почти клановый характер. Носители этой фамилии, скорее всего, происходят из одного рода или селения, где прозвище закрепилось за предком-говоруньей или наставником.