Фамилия Айтюрин — редкая и неочевидная для русского уха. На первый взгляд она напоминает фамилии на -ин, образованные от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а/-я: скажем, Птицын или Синицын. Но в основе здесь не птица и не животное, а тюркское или, точнее, арабо-тюркское имя.

Корень «Айтюр» (или «Айтур») скорее всего восходит к двум компонентам: «ай» (луна, месяц) и «тюр» (в тюркских языках может означать «стоять», «пребывать», а в некоторых диалектах — «вид», «образ»). В целом «Айтюр» можно перевести как «луноликий» или «подобный луне» — типичное для восточной антропонимии поэтичное прозвище или мужское имя, которое давали ребёнку с пожеланием красоты и светлой судьбы. Фамилия образована по русской модели: к основе Айтюр добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Айтюрин), то есть «сын Айтюра».

Стоит отметить, что фамилия не входит в списки массовых русских фамилий и почти не встречается за пределами регионов с тюркским населением — Поволжья, Урала, юга Сибири. Носители Айтюриных, вероятно, имеют татарские, башкирские или казахские корни, но сама фамилия оформлена уже по русскому образцу, что говорит о длительном межэтническом контакте и переходе на русскую систему фамилий в XVIII–XIX веках. Других версий происхождения — от географических названий или забытых ремёсел — для этой фамилии не предлагается, и придумывать их не стоит.