Фамилия Ажеев — редкий случай, когда в основе лежит не имя или профессия, а слово, ушедшее из живого языка. Её ядро — древнерусское «аж» или «оже», что значит «если, хотя, даже». В старину это было не союзом в современном понимании, а междометием или наречием: «аже» — «вот, так, даже». Человек, получивший прозвище Ажей, мог быть тем, кто часто вставлял это слово в речь — «аже ты», «аже он» — то есть говорил с характерной присказкой. В русских говорах такие прозвища давали людям по их любимым словечкам: Брех, Чаво, Ай, Аже.

Суффикс -ев указывает на патронимическое происхождение: Ажеев — сын Ажея. Модель образования типична для русских фамилий, но основа необычна. В отличие от фамилий от крестильных имён (Иванов, Петров) или ремёсел (Кузнецов, Плотников), Ажеев стоит в ряду прозвищных фамилий, где закреплялась не социальная роль, а личная черта — манера речи, привычка или поведение.

Версия с тюркским корнем выглядит менее убедительной. В некоторых тюркских языках «аж» означает «горький» или «кислый», но для русской фамилии с суффиксом -ев такая основа — редкость. Скорее всего, Ажеев — исконно русское прозвище, записанное в северных или центральных губерниях, где «аже» бытовало как диалектное слово. Географически фамилия встречается рассеянно, без плотного гнезда, что характерно для прозвищ, а не для фамилий от канонических имён.

Ономастический словарь Б. Унбегауна не выделяет Ажеева отдельно, но разбирает аналогичные модели: фамилии от междометий и союзов — Айкин, Охов, Нужин. Ажеев вписывается в этот ряд. Социальный статус предков мог быть любым: прозвище по присказке не привязано к сословию. Если судить по редким архивным записям XIX века, носители фамилии числились в основном крестьянами и мещанами, но это не исключает иных вариантов.