Фамилия Бабка — одна из тех, что кажется простой и понятной, но на деле скрывает несколько возможных историй происхождения. Самое очевидное объяснение — прозвище от слова «бабка» в значении «повитуха» или «знахарка». В народе говорили: «Хорошо на свете жить, кому бабка ворожит». Так могли прозвать человека, который обращался за помощью к ворожее, или, что вероятнее, самого знахаря — мужчину, занимавшегося врачеванием и заговорами. Не исключено, что Бабкой могли прозвать и сплетника, поскольку слово имело и переносное значение — «болтливая женщина», хотя такое прозвище для мужчины встречается реже.

Модель образования здесь нестандартная. Фамилия застыла в форме именительного падежа единственного числа, без типичных суффиксов -ов, -ин или -ский. Это указывает на её прозвищное происхождение: человека так и звали в быту — Бабка, и это обращение закрепилось за его потомками. Подобные «голые» фамилии (без суффикса) чаще встречались на Украине и в южнорусских землях, но встречаются и в северных областях.

В исторических документах прослеживаются однокоренные фамилии. Известны Бабкины — бояре, упоминаемые в XV веке в Новгороде. Афанасий Бабкин служил дьяком в Москве в 1546—1560 годах. Другой род Бабкиных записан в Твери как отрасль рода Марка Демидова. Эти факты говорят о том, что основа «бабк-» была распространена в разных слоях общества, от боярства до служилых людей, а сама фамилия Бабка могла быть более ранней или простонародной формой, от которой позже образовались патронимические варианты на -ин.

Главное отличие фамилии Бабка от более частых Бабкиных — в её окончании. Если Бабкин означает «сын Бабки», то Бабка — это прямое прозвище, которое не нуждалось в переосмыслении через отчество. Такой тип фамилий встречается реже и часто указывает на прямое, даже несколько фамильярное отношение к носителю в прошлом.