Фамилия Балахчина — довольно редкая, и её значение напрямую связано с конкретным географическим или бытовым понятием. Основа здесь — слово «балахна» или «балахон». Самая прямая версия: прозвище Балахча могли дать человеку из города Балахна (ныне Нижегородская область). Жителей этого города называли балахонцами, а выходца — Балахной или Балахчей. В таком случае фамилия указывает на место, откуда человек родом, и отвечает на вопрос «чей?» — сын Балахчи.

Вторая, не менее вероятная версия, отсылает к одежде. Балахон — просторная верхняя одежда, часто холщовая или мешковатая. Прозвище Балахча мог получить человек, который носил такой балахон, шил их или торговал ими. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «Балахчин» означало «сын Балахчи» или «из семьи Балахчи». Поскольку прозвища на -ча (как Балахча) характерны для северных и волжских говоров, географическая привязка к Балахне здесь выглядит особенно органично.

Важно отметить, что в фамилии пишется «ч», а не «ш» (не Балахшина). Это сохраняет исходный звук прозвища. Встречаются варианты с ударением на второй слог (Бала́хчина) и на последний (Балахчи́на), что может зависеть от местного говора. Фамилия недворянская и не книжная, а народная, прозвищная. Носители Балахчины почти наверняка происходят из крестьянской или мещанской среды, скорее всего, из Поволжья или центральной России.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает эту логику. Балахнин, Балахонов, Балахонцев — все они образованы от тех же корней, но с разными суффиксами. Балахчина стоит особняком именно из-за редкого суффикса -ча, который в русских фамилиях встречается нечасто и обычно указывает на прямое прозвище, а не на отчество от крестильного имени. Поэтому наиболее вероятно, что первый Балахча был либо приезжим из Балахны, либо человеком, которого в округе знали по его балахону.