Фамилия Балюченко — типичный пример украинской модели фамилии на -енко, которая в XVI–XVII веках стала массово вытеснять более старые формы на -ович/-евич. В буквальном смысле Балюченко означает «сын Балюка» или «потомок человека по прозвищу Балюк». Суффикс -енко (с чередованием к/ч) — один из главных маркеров украинской ономастики, и именно по нему фамилию безошибочно относят к восточнославянскому, скорее всего малороссийскому, ареалу.

Основа фамилии — прозвище Балюк. Его происхождение неоднозначно, и здесь стоит разобрать две основные версии. Первая и самая прямая: Балюк — производное от слова «баля» или «баляка». В украинских и южнорусских говорах «баля» означало «балка», «бревно», «колода», а также «болтун», «пустомеля». Прозвище могли дать человеку неуклюжему, грузному, либо, наоборот, словоохотливому, любящему «балякать» — болтать. Вторая версия связывает Балюка с именем Бал (сокращение от Балтазар или, реже, от славянского Балимир), но это менее вероятно: на Украине XVII–XVIII веков библейское имя Балтазар встречалось редко, и прозвищная природа Балюка выглядит убедительнее.

Интересная деталь: фамилия Балюченко почти не встречается в центральных и северных регионах Украины (где преобладают фамилии на -енко от крестильных имён), а тяготеет к югу и западу — Подолье, Волынь, Галиция. Это наводит на мысль, что прозвище Балюк могло быть занесено переселенцами или же образовалось локально, в среде, где «баля» имело хождение. В документах XIX века, например, по Киевской и Подольской губерниям, фамилия фиксируется среди крестьян и мещан, то есть её носители не принадлежали к дворянству или духовенству — типичная народная фамилия.

Если сравнивать с однокоренными вариантами — Балюк, Балюков, Балюченков, — то Балюченко стоит особняком: оно не обрусело, не потеряло суффикса, сохранив украинскую грамматику. Это говорит о том, что предки носителя фамилии долго оставались в украинской языковой среде, возможно, в сельской местности, где фамилии реже меняли под влиянием великорусского делопроизводства. Встречается и написание с одной «л» — Баюченко, но это, скорее всего, результат описки или диалектного произношения, где «л» выпадает.