Фамилия Балзерис — редкий пример балтийского наследия в русском ономастиконе. По своей модели это типичная литовская фамилия с суффиксом -ис (-is), который в литовском языке указывает на мужской род и часто оформляет прозвища или именования по признаку. В русской среде такой суффикс сохраняется без изменений, что отличает фамилию от русифицированных вариантов вроде Балзеров или Балзеринов.

Основа фамилии, скорее всего, восходит к литовскому слову balsus — «звучный», либо к глаголу balzgėti — «грохотать, греметь, стучать». Оба корня описывают звуковую характеристику человека: первый — обладателя красивого, звонкого голоса, второй — шумного, неповоротливого или громкого в движениях человека. В литовской народной традиции прозвища по звуку или голосу (например, Balsys, Balsis) встречаются нередко, и Балзерис может быть их диалектной или фонетической разновидностью.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи — территории современной Литвы и приграничных областей Беларуси и Польши. В метрических книгах XIX века Балзерисы встречаются среди крестьян и мещан Ковенской и Виленской губерний. Сословная принадлежность — в основном крестьянство, реже городские ремесленники.

Словообразовательная модель не оставляет сомнений в литовском происхождении: финаль -ис типична для мужских фамилий в Литовском княжестве, и при переходе в русскую среду фамилия не получила типичных славянских суффиксов (-ов, -ин), что говорит о поздней или неполной русификации. В современных русских документах фамилия встречается редко, но сохраняет исходное написание, что делает её ценным маркером балтийских корней рода.