Фамилия Бамалкиров — один из тех редких случаев, когда основа слова не поддаётся однозначной славянской этимологии. Если отбросить типичный русский суффикс принадлежности -ов (отвечающий на вопрос «чей?»), то остаётся корень «Бамалкир». В русском языке такого слова нет, и это главная загадка.

Скорее всего, перед нами фамилия тюркского или кавказского происхождения, которая при записи в российских документах получила русское окончание. Модель образования типична для XIX — начала XX века: иноязычное прозвище или имя + русский суффикс -ов. Носитель такой фамилии мог быть выходцем из татарской, башкирской, кумыкской или ногайской среды, где существовали личные имена с компонентом «Бал» (богатый, медовый, сладкий) и «Кир» (пустыня, поле, степь). В тюркских языках «Бал-Кыр» может означать «медовая степь» или «сладкое поле» — возможно, прозвище человека, жившего у плодородного пастбища.

Есть и другая, менее вероятная версия: фамилия могла возникнуть от искажённого при переписи балкарского или осетинского имени. В тюркских языках Кавказа встречается имя Балкир, а суффикс «-ир» иногда указывает на деятеля. Тогда Бамалкиров — это «сын того, кто делает мёд» (пасечник) или «сын богатого степняка».

Суффикс -ов здесь не родовой, а «канцелярский»: его добавили при крещении или записи в ревизские сказки, чтобы подогнать фамилию под русский стандарт. Поэтому географию фамилии стоит искать в Поволжье, на Северном Кавказе или в Оренбургской области — там, где русские чиновники массово оформляли документы тюркоязычному населению.

Написание фамилии с буквой «а» в первом слоге (Бамалкиров вместо Балмалкиров) — скорее всего, результат акающего произношения или ошибки писаря. Встречаются варианты Балмалкиров и Балмалкирян, но основной, закрепившийся в паспортах — именно Бамалкиров. Это редкая фамилия, её носители, вероятно, происходят из одного небольшого рода.