Фамилия Бардюркин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Если отбросить первые же догадки, которые обычно ведут к экзотическим или заимствованным корням, то наиболее вероятная версия окажется чисто русской, связанной с прозвищем, данным за манеру поведения.

Самая правдоподобная версия выводит фамилию из диалектного слова «бардюрка». В некоторых русских говорах, особенно на севере и в Сибири, так называли ворчливого, брюзгливого человека, который постоянно бормочет себе под нос или говорит невнятно. Слово образовано от глагола «бардюрить» или «бардырить» — бормотать, ворчать. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Бардюркин — это сын Бардюрки, то есть потомок ворчуна или невнятно говорящего человека.

Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит географическое название. Например, топоним Бардюрка или Бардюр мог существовать локально, но в доступных справочниках по русским селениям он не зафиксирован. Также стоит упомянуть, что фамилия может быть искажённой формой от более известной Бардыкин (от прозвища Бардыка — заика, картавый). В этом случае переход «ды» в «дю» мог произойти из-за акающего произношения или ошибки писаря.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще получали крестьяне и мещане по имени отца, фамилия с суффиксом -ин могла принадлежать как крестьянину, так и служилому человеку низшего ранга. Сословной границы у таких прозвищных фамилий практически не было. Судя по всему, предок носителя фамилии Бардюркин получил своё прозвище не за профессию, а за характерную речевую особенность — ворчливость или неразборчивую речь.