Фамилия Батбуян — редкая и с первого взгляда загадочная. Её основа, скорее всего, не славянская, а тюркская или монгольская. В этих языках «бат» часто означает «крепкий», «сильный», а «буян» — «богатство», «изобилие» или даже «бунт» (в переносном смысле — буйный, полный сил). Таким образом, исходное прозвище Батбуян могло означать «крепкое богатство» или «сильный, как богатство» — имя-пожелание, типичное для кочевых народов.

Фамилия образована без типичного русского суффикса (-ов, -ин, -ский). Это так называемая «застывшая» форма прозвища, которая не менялась при переходе в фамилию. Такое встречается у фамилий, пришедших из тюркской или калмыцкой среды, особенно в среде казаков или крестьян южных регионов России. Носитель фамилии мог быть потомком калмыка, татарина или башкира, который получил прозвище по имени или по черте характера, а при переписи его записали просто «Батбуян».

Вторая, менее вероятная версия — что «Батбуян» это искажённое славянское прозвище, например, «Бат» как сокращение от «батя» (отец) и «буян» как «буйный, драчун». Но такое сочетание маловероятно: «батя-буян» звучит искусственно, и в реальных говорах не фиксируется. Скорее всего, перед нами именно восточное имя.

Географически фамилия Батбуян встречается в единичных случаях, в основном в республиках Северного Кавказа, в Калмыкии и в Астраханской области. Это подтверждает её восточное происхождение. Сословно носители могли быть из казаков, крестьян или мелких служилых людей, контактировавших с кочевыми народами. Никаких громких исторических личностей с этой фамилией не известно, что и неудивительно для столь редкой фамилии.