Фамилия Батоврин образована по типичной для русских фамилий модели — с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Батоврин, то есть сын или потомок Батовра. Основа здесь неочевидная, и это как раз тот случай, когда фамилия сохранила в себе редкое или забытое прозвище.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Батовр. Его можно разобрать на две части: «бат» и «овр». Первая часть, «бат», в русских говорах и в именах не редкость — от слова «батя», «батька» (отец, старший) или от тюркского «батыр» (богатырь, храбрец). Вторая часть, «-овр», может быть диалектным вариантом слова «овраг» (в северных и центральных говорах произносили «оврáг»). Тогда Батовр — человек, живший у «батькиного оврага», или прозвище, данное по месту. Но более правдоподобна другая версия: «Батовр» — это искажённое «Батыр» (батыр, богатырь), с добавлением протетического «-ов-» для благозвучия. В документах XVII–XVIII веков встречаются фамилии Батырев, Батыршин, а Батоврин мог возникнуть как диалектный вариант: в некоторых регионах «а» после твёрдого согласного переходило в «о» (аканье, но на письме фиксировали как «о»), и «батыр» превращался в «ботыр» или «батовр».

Суффикс -ин указывает, что фамилия закрепилась в среде, где преобладала именно эта модель — на севере и в центральной России, в отличие от южных областей с суффиксом -ов/-ев. Географически фамилия редкая, встречается точечно: основные следы — в Вологодской, Костромской и Кировской областях, что косвенно подтверждает севернорусское происхождение. Носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, а прозвище могло достаться родоначальнику за силу или за место жительства.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в одном ряду с Баталовым, Батеевым, Батыревым, но отличается редким суффиксальным оформлением. Если сравнивать, Батоврин — более архаичная форма, сохранившаяся в глухих районах, где ономастикон менялся медленнее.