Фамилия Баякбаева — яркий пример тюркского именования, попавшего в русский обиход. Её корни ведут в казахскую или киргизскую среду, где она образована по классической для этих языков модели. Основа — мужское имя Баякбай, которое состоит из двух частей: «бай» (богатый, господин, хозяин) и «Баяк» — тюркское имя, в основе которого лежит слово со значением «смотреть», «глядеть» или «присматривать». Таким образом, имя Баякбай можно истолковать как «богатый (или господин) с зорким взглядом» или «тот, кто богат прозорливостью». Встречается и другой вариант: «Баяк» могло быть древним племенным именем, и тогда имя означало «богач из рода Баяк».

Фамилия оформлена по русскому образцу: к основе Баякбай прибавлен женский суффикс -ева, указывающий, что носительница — женщина. Мужской вариант фамилии — Баякбаев. Такая модель (тюркское имя + русский суффикс) в XIX–XX веках была типична для народов Средней Азии и Казахстана, когда при записи в метрики или паспорта местные имена адаптировали к имперским стандартам. В отличие от русских фамилий на -ов, которые шли от отчества, здесь суффикс просто «обрусил» исходное имя, превратив его в наследственную фамилию.

Географически фамилия Баякбаева чаще всего встречается в Казахстане, особенно в южных и центральных областях, а также среди казахов в России (Оренбургская, Астраханская области). Встречается она и в Кыргызстане, но реже. Из-за того, что фамилия образована от личного имени, а не от прозвища или ремесла, её носители в прошлом не принадлежали к какому-то одному сословию — имя Баякбай мог получить любой мальчик, и его потомки, став Баякбаевыми, могли быть и скотоводами, и ремесленниками, и торговцами.

Интересная деталь: ударение в фамилии обычно падает на последний слог — Баякба́ева, что свойственно многим тюркским фамилиям в русском языке, где ударение смещается на окончание. В самой тюркской основе имя произносилось бы с ударением на первый слог — Бая́кбай. Эта разница в ударении — следствие адаптации слова к русской фонетике.