Фамилия Баймаханова образована от казахского мужского имени Баймахан, которое восходит к двум основам. Первая из них, слово «бай», в переводе с тюркского и казахского языков обозначает «богатый или уважаемый человек». В наше время служит частью слова, также символизирует изобилие, богатство. Вторая основа, Махан, является сокращенной формой от имени Мухаммед, которое означает «восхваляемый, прославляемый». Вероятно, нарекая сына именем Баймахан, родители желали ему в будущем стать достойным мусульманином, что неудивительно для традиционного общества, где очень важное значение придается религии. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Баймахановых можно лишь на основании генеалогических исследований.