Фамилия Баймуканов — типичный пример тюркской модели именования, перешедшей в русскую фамильную систему через суффикс -ов. Разложить её на части проще всего: основа «Баймукан» и русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность («чей?» — Баймуканов, то есть сын Баймукана). Сама же основа — это сложное тюркское имя, которое в русской традиции записали без изменений.

Разберём составное имя Баймукан. Первая часть «бай» в тюркских языках означает «богатый», «господин», «знатный». Вторая часть «мукан» — менее прозрачна. Скорее всего, это вариант имени «Муккан» или «Муган», которое восходит к арабскому «Мухаммад» (прославленный), прошедшему через тюркскую фонетику. В казахском, башкирском и татарском языках имя «Мұқан» — распространённая краткая форма от Мухаммеда. Таким образом, Баймукан — это «богатый Мукан» или «знатный, как Мухан». Имя давали с пожеланием достатка и уважения, соединяя социальный статус («бай») с религиозно-почитаемым именем.

Географически фамилия Баймуканов плотно привязана к Казахстану и прилегающим регионам России (Оренбургская, Астраханская области, Башкортостан). Это не случайно: в казахской среде фамилии на -ов стали массово закрепляться в XIX — начале XX века, при переписях и паспортизации. До этого человека называли по имени отца (Баймукан-улы — «сын Баймукана»), а при записи в русские документы просто русифицировали отчество, добавив окончание.

Интересная деталь: в отличие от многих русских фамилий, образованных от крестильных имён, Баймуканов сохранил двойную тюркскую основу без редукции. Встречаются варианты написания с одной «н» (Баймуканов) и двойной (Баймуканнов) — второй вариант отражает попытку подчеркнуть, что имя оканчивается на «ан», и прибавить суффикс -ов. Но нормативным для русского языка стало написание с одной «н», как в фамилиях Абрамов, Иванов.

Социальный срез фамилии типичен для кочевого и полукочевого населения: предки Баймукановых — скотоводы, земледельцы или ремесленники, получившие фамилию по имени уважаемого родоначальника. Никакого дворянства или купечества за этой фамилией, как правило, не стоит — это фамилия «простого» народа, но с глубокой родословной, уходящей в тюркские имена-пожелания.