Фамилия Баймуханбетов образована от имени Баймуханбет, которое состоит из двух частей: «бай» и «муханбет». Первая из них берет начало от древнетюркского нарицательного «бай» со значением «господин, богатый человек». Вторая часть имени Баймуханбет является одним из вариантом имени Мухаммет. Оно в переводе с арабского языка на русский означает «восхваляемый, прославляемый». Таким образом, именование Баймуханбет можно трактовать как «господин Мухаммет». Таким образом, потомок человека, которого звали Баймуханбет, со временем получил фамилию Баймуханбетов. Тюркский корень -огло/-оглу/-оглы (в переводе «потомок, сын») типичен для турецких, гагаузских и прочих тюркских фамилий.