Фамилия Байрахтарян — яркий пример армянской фамилии, образованной от тюркского корня. Её основа — слово «байрак» (знамя, флаг), а суффикс «-тар» (держатель) в сочетании с армянским патронимическим окончанием «-ян» (принадлежность) даёт значение «сын знаменосца». Таким образом, предок носителя этой фамилии, скорее всего, нёс знамя в войске или был знаменосцем на поле боя — должность почётная и ответственная, так как потеря знамени считалась позором для всего отряда.

В русском языке фамилия закрепилась в форме Байрахтарян, хотя в армянской среде встречаются варианты Байрактарян (с буквой «к» в середине) или Байрактар. Это объясняется тем, что тюркское «bayrak» (знамя) в армянской передаче могло звучать с оглушением или без него. Само слово «байрак» хорошо знакомо по топонимам (например, Байрак в Украине или Байрактар в Турции) и фамилиям других народов, например, у татар или азербайджанцев встречается фамилия Байрактаров.

Географически фамилия Байрахтарян распространена в основном среди армян, чьи предки жили в регионах, где были сильны тюркские языковые влияния, — в Западной Армении (исторические области Васпуракан, Сасун) или в Нагорном Карабахе. После геноцида армян 1915 года и последующих миграций носители фамилии оказались в диаспоре — в России, США, Франции, Ливане. В самой Армении фамилия встречается, но не так часто, как, скажем, Петросян или Оганесян.

Интересно, что в османской армии существовал чин «байрактар» — знаменосец янычарского корпуса, и некоторые армянские семьи, принявшие ислам, могли сохранить эту фамилию в форме Байрактар. Однако для армян-христиан фамилия Байрахтарян — чисто патронимическая, без прямой связи с военной службой: она просто указывает на предка, который когда-то прославился как знаменосец.