Фамилия Бекинтис — пример редкой и архаичной модели, напрямую связанной с литовской антропонимической традицией. Её основа — древнее литовское имя Бекинт, которое, в свою очередь, складывается из двух смысловых частей. Первая часть — отрицательная частица be, соответствующая русским приставкам «без-» или «бес-». Вторая часть восходит к древнему литовскому глаголу kinta, что значит «преображаться, меняться». Сложив их, получаем значение «неизменный», «постоянный».

Такое имя могли дать сыну с пожеланием, чтобы он хранил верность родовым традициям и обычаям, не поддавался переменам и оставался твёрдым в своих убеждениях. С точки зрения словообразования, фамилия Бекинтис оформлена литовским суффиксом -ис, который в мужских фамилиях указывает на принадлежность или происхождение. По сути, Бекинтис — это «сын Бекинта» или «человек из рода Бекинтов».

Эта фамилия характерна для исторических территорий Литвы и прилегающих районов Беларуси, где литовский антропонимикон оставил заметный след. В отличие от более распространённых славянских фамилий на -ов или -ин, модель на -ис встречается реже и почти всегда указывает на балтские корни. Встречаются и варианты написания — например, Бекинтас или Бякинтас, но форма Бекинтис считается более точной с точки зрения литовской орфографии.

Среди однокоренных фамилий можно назвать Бекянтас, Бекянтис, а также фамилии с корнем -кинт- в составе, например, Кинтас или Кинтелис. Все они восходят к тому же глаголу kinta и несут в себе идею изменения или, с отрицанием, неизменности. Фамилия Бекинтис не относится к числу массовых, и её носители сегодня встречаются в основном в Литве, а также среди потомков литовских эмигрантов в США и Западной Европе.