Фамилия Бекусова — женская форма фамилии Бекусов, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Бекус. В русской ономастике это редкий случай, когда основа на первый взгляд кажется иноязычной, но при ближайшем рассмотрении может оказаться вполне местной, диалектной.

Самая правдоподобная версия — связь с тюркским компонентом «бек» (князь, господин, сильный), широко распространённым в составе фамилий у народов Поволжья и Северного Кавказа. В таком случае Бекус — это либо уменьшительная форма от имени Бек (ср. Бекмурза, Бекхан), либо прозвище, означающее «похожий на бека», «ведущий себя по-княжески». Суффикс -ус в тюркских заимствованиях встречается редко, но не исключён: он мог появиться под влиянием русской народной этимологии или как адаптация окончания -уз, -ыш.

Однако есть и альтернатива, которую стоит рассмотреть: Бекус могло быть прозвищем, данным русскому человеку за манеру речи или поведения. В некоторых северных и сибирских говорах слово «бекать» означало «заикаться», «мямлить», а «бекус» — заика. Если это так, то фамилия Бекусов — чисто русская, образованная по модели прозвищ на -ус (ср. Косой — Косоус, Хромой — Хромуса). Эта версия менее популярна, но лингвистически состоятельна, особенно если учесть, что фамилия встречается в центральных и северных областях России, где тюркское влияние было слабым.

Словообразовательная модель фамилии — притяжательное прилагательное с суффиксом -ов (в женском роде -ова), что характерно для русского крестьянского и мещанского сословия. Это значит, что родоначальника звали Бекус, и его дети или жена получили фамилию по отцу. В документах XVII–XIX веков такие фамилии фиксировались как «Бекусов сын» или «Бекусова жена».

География фамилии Бекусова довольно размыта: единичные носители встречаются в Вологодской, Кировской областях, а также в Татарстане и Башкортостане. Эта разбросанность как раз и говорит о том, что корни могли быть разными: в одном случае — тюркские, в другом — русские диалектные.

Стоит отметить, что фамилия не относится к числу дворянских или купеческих: в исторических списках она не встречается среди знати. Скорее всего, предки Бекусовых — крестьяне или однодворцы, жившие на границе расселения русских и тюркских народов.